NVIDIA BioNeMo accelera la scienza antropica di Claude

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Claude Science antropica ora integra il Kit degli strumenti dell’agente NVIDIA BioNeMo accelerare la ricerca computazionale nelle scienze della vita.

Anthropic ha lanciato la beta pubblica di Claude Science, un banco di lavoro AI creato per la ricerca scientifica. La piattaforma consente agli scienziati di conversare direttamente con gli agenti digitali utilizzando il linguaggio naturale per eseguire flussi di lavoro di ricerca end-to-end. Questo sistema si connette in modo nativo a NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit, esponendo le risorse di elaborazione ad alte prestazioni come competenze richiamabili all’interno dell’ambiente Claude.

NVIDIA ha creato quello che molti considererebbero lo stack di calcolo accelerato da GPU più completo al mondo contenente hardware fisico, framework software, librerie operative, modelli scientifici, microservizi e strumenti specifici del dominio. Questa base hardware e software consente ai ricercatori di eseguire flussi di lavoro sofisticati e aumentare la velocità di iterazione.

L’integrazione importa modelli accelerati da NVIDIA, librerie computazionali e microservizi NIM NVIDIA nell’ambiente in cui gli scienziati conducono la loro ricerca primaria. 18 delle 20 principali aziende farmaceutiche globali implementano già NVIDIA BioNeMo nei loro ambienti di produzione, dimostrando la sua elevata penetrazione nell’ecosistema.

Claude Science traduce l’intento del linguaggio naturale in un’azione operativa. I ricercatori evitano di configurare manualmente modelli predittivi, impostare endpoint di rete o gestire ambienti software complessi. Lo scienziato descrive un compito di ricerca specifico – come analizzare una sequenza genomica, prevedere una struttura proteica precisa o progettare un potenziale legante molecolare – e Claude Science interpreta la richiesta in testo semplice e orchestra l’esecuzione risultante utilizzando agenti preconfigurati e specializzati nel dominio.

Esecuzione di flussi di lavoro di progettazione molecolare complessi

Questi agenti specializzati comprendono protocolli di laboratorio e computazionali consolidati in genomica, proteomica, analisi di singole cellule, chemioinformatica e ricerca clinica. Il toolkit NVIDIA fornisce a questi agenti scientifici il contesto dei dati necessario per mappare ogni fase operativa sulla corretta capacità NVIDIA.

Il toolkit racchiude le funzioni accelerate da NVIDIA come competenze programmatiche specifiche e richiamabili. Fornisce agli agenti informazioni dettagliate sullo scopo esatto di ogni strumento specifico e sugli input di dati richiesti. Questa configurazione consente a Claude Science di selezionare lo strumento di calcolo corretto, formattare input di dati validi, eseguire il lavoro di elaborazione sulle risorse di elaborazione NVIDIA distribuite e restituire l’output finito per la revisione umana.

L’integrazione stabilisce un ciclo iterativo veloce tra il ragionamento scientifico umano e l’elaborazione computazionale accelerata dalla macchina. Gli scienziati ispezionano i risultati generati, perfezionano le loro query specifiche e determinano i passaggi successivi mantenendo la loro attenzione interamente sulla scienza di base.

La produzione di inibitori migliori per bersagli comuni del cancro dimostra l’applicazione pratica di questo sistema implementato. Uno scienziato avvia il processo identificando una mutazione antigenica nota che causa il cancro. Il ricercatore chiede quindi a Claude di progettare numerosi potenziali inibitori mirati a quella specifica mutazione. Claude Science lavora in tandem con BioNeMo Agent Toolkit e i microservizi NVIDIA NIM per accelerare l’intera pipeline di previsione, ottimizzazione e successiva convalida degli inibitori ad alto rendimento.

Accelerazione delle pipeline di dati genomici e unicellulari

Il toolkit garantisce agli scienziati l’accesso a flussi di lavoro accelerati e modelli aperti avanzati, tra cui Evo 2, Boltz-2 e OpenFold3. Questi modelli offrono capacità biomolecolari basate sulle librerie software NVIDIA, garantendo che l’agente autonomo possieda un modello scientifico appositamente creato per ogni fase distinta del flusso di lavoro.

Gli agenti di intelligenza artificiale necessitano di strumenti computazionali specializzati per ragionare, pianificare e completare compiti nell’ambito delle scienze della vita. Un unico flusso di lavoro completo potrebbe richiedere all’agente di rilevare un’enorme libreria di composti, raggruppare risultati molecolari promettenti, generare conformeri per i migliori candidati strutturali, analizzare il contesto genomico e confrontare le risposte alle perturbazioni prima di raccomandare il successivo esperimento di laboratorio fisico.

Un agente opera alla stessa velocità con cui vengono eseguiti i suoi strumenti computazionali sottostanti. NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit fornisce a questi agenti strumenti accelerati per operare alla massima velocità hardware. L’analisi genomica elaborata tramite NVIDIA Parabricks passa da ore a minuti, consentendo all’agente di prendere in considerazione il contesto genomico complesso nelle decisioni operative quasi in tempo reale.

Lo strumento RAPIDS-singlecell, sviluppato da scversecomprime un flusso di lavoro di preelaborazione e clustering di 1,3 milioni di celle da 52 minuti a 25 secondi. Questa drastica riduzione della velocità trasforma l’analisi di una singola cella in una parte attiva del ciclo di ragionamento dell’agente anziché in un lavoro batch offline ritardato. nvMolKit accelera fino a 3.000 volte le attività di chemioinformatica come la ricerca di similarità e la generazione di conformeri, fornendo risultati rapidamente mentre l’agente esegue l’iterazione attraverso enormi spazi chimici.

Standardizzazione delle distribuzioni di produzione con i microservizi NIM

I team richiedono meccanismi di distribuzione stabili per queste pipeline di modellazione avanzate. NVIDIA confeziona i suoi modelli biomolecolari aperti come microservizi BioNeMo NIM. Funzionano come endpoint di inferenza pronti per l’azienda e personalizzati per gli ambienti di produzione.

I microservizi sono completamente containerizzati e presentano uno stack software preintegrato, ottimizzato e accelerato progettato per l’inferenza ad alte prestazioni. L’agente autonomo interagisce con un’unica API stabile per attivare queste distribuzioni di produzione remota.

NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit rimane aperto e indipendente dal cablaggio. Questo design architettonico garantisce che le stesse competenze scientifiche funzionino in modo coerente tra diversi framework di agenti e piattaforme di ricerca aziendale indipendenti.

I team di ingegneri possono scaricare il toolkit e le competenze scientifiche ad esso associate tramite le risorse per sviluppatori NVIDIA e i repository di codice GitHub. Durante la fase beta pubblica attiva, Anthropic richiede feedback diretto ai ricercatori in merito alle integrazioni software necessarie e ad ulteriori specialisti di dominio.

Vedi anche: Anthropic distribuisce Claude Sonetto 5, Favola e Miti restaurati

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Fonte: www.artificialintelligence-news.com

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